浙大团队《Nature》发文,世界首个人类细胞图谱成功绘制
该研究团队的成果建立了人类细胞图谱的基本框架。
近日,浙江大学医学院干细胞与再生医学中心郭国骥团队与浙江大学附属医院张丹团队、王伟林团队、陈江华团队、梁廷波团队和黄河团队等联合在《Nature》上发表研究成果,该成果名为“Construction of a Human Cell Landscape at Single-cell Level”,论文显示该团队成功绘制了世界首个人类细胞图谱。
图 | 一张单细胞水平的人类细胞图谱
据了解,该研究团队对60种人体组织样品和7种细胞培养样品进行了Microwell-seq高通量单细胞测序分析,系统性地绘制了跨越胚胎和成年两个时期,涵盖八大系统的人类细胞图谱。
研究过程中,团队已经建立了70多万个单细胞的转录组数据库,并鉴定了人体100余种细胞大类和800余种细胞亚类。同时,他们也开发了scHCL单细胞比对系统用于人体细胞类型的识别,搭建了人类细胞蓝图网站。
通过这一研究,团队建立了人类细胞图谱的基本框架,发现成人非免疫细胞的广泛免疫激活,提出内干细胞和祖细胞的分化过程是一个细胞基因表达从混乱到有序的过程,并认为基因组中的调节子预先决定了分化终端的稳定状态。
针对图谱对医学临床的帮助,郭国骥表示,“我们现在建立的是正常细胞的单细胞转录组的数据库,可以用于再生医学种子细胞的鉴定。未来如推广到疾病细胞图谱,便有可能运用到疾病的单细胞水平诊断上。细胞图谱的数据对于理解疾病的发生有重要意义,但临床治疗方面的应用尚需要更多的积累。”
另外围绕成果本身,郭国骥也说到,“我们的工作在测序深度和细胞数目上都存在局限性,但是在跨组织和跨物种的数据可比性上有较大优势。完美版的人类细胞图谱还应该整合空间信息、多组学数据和人群分析,这需要全世界科学家的共同努力。”
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