单细胞多组学如何运用到临床及药物研发?
从2012年,北京寻因生物创始人李宗文博士就进入NGS检测领域工作。从科研到临床,李宗文博士见证了新技术的迭代。“新技术的开发应用是一个令人兴奋的过程”,单细胞测序的崛起吸引了李宗文博士的目光,2018年,他和自己曾经的同事一起创立了寻因生物。
寻因生物是一家自主研发单细胞技术的精准医疗生物医药企业,拥有国内独家微孔芯片与油包水双技术平台,致力于通过国产高通量单细胞全链条产品及服务,将单细胞技术普适化,应用于临床及药物研发,助力相关疾病研究。
目前寻因已与百余家科研院所、医疗机构、制药企业开展深度合作,实现了商业运营。
微孔芯片平台的核心产品是SeekOne MM高通量单细胞转录组试剂盒,该试剂盒无需昂贵的硬件配套,操作较为简单直观。运用独特的核酸标记技术可以保证更少的平衡文库依赖,且双标系统确保结果精确。实验表明,其千级细胞的双细胞率低至0.7%。
9月份即将推出的油包水检测平台的产品是SeekOne DD油包水仪器,通过该仪器的单细胞转录组检测需经过4个步骤:
1. 首先将单细胞悬液放入双十字交叉型微芯片,形成包含细胞、Gel Beads以及试剂的微液滴。
2. 经过几分钟后,微液滴内细胞裂解,Barcode序列释放,标记细胞的不同组学信息,并逆转录包含Barcode和UMI片段在内的cDNA。
3. 当油滴破碎后,以cDNA为模板,进行PCR扩增、建库,并进行二代测序(NGS)。
4. 最后,通过生物信息学的方法,并根据Barcode和UMI,从测序数据中拆分出完整的单细胞组学信息。
除产品外,寻因还可提供全国上门解离服务。经验丰富的解离团队运用自主研发的样本解离仪和解离液,为客户提供高成功率的解离服务。目前,寻因生物可以完成100多种组织单细胞悬液制备,包含神经系统、循环系统、运动系统、内分泌系统、泌尿系统、呼吸系统、生殖系统、消化系统等。
根据自主研发的可视化云平台与试剂盒、仪器配套化信息分析软件,与专有数据库、阿里云弹性计算结合,为客户提供个性化分析方案,满足自主操作应用分析需求。
经过分析评估,寻因质控基本分析软件与10xcellranger分析性能评估结果细胞一致率>99%,RNA expression相关性>0.99,细胞聚类tSNE结果高度一致,细胞聚类结果在相同cluster的一致率>99%。
寻因生物通过科研及临床服务积累数据资源,并结合科研成果及公共数据库提供深度解读。目前已有300余项研究,细胞数据100多项,细胞标记1万余个。
此外,其可视化云计算平台与单细胞数据库、自动化注释软件的配合可以解决单细胞分析的瓶颈——细胞类型注释。操作简便,可实现拖拽式自定义分析流程与输出可视化报告。
“在数据基础解析过程中,耗时是比较长的,因此我们做了流程优化和系统改造,从而将信息分析流程控制在8个小时内。”李宗文博士表示。
经透露,今年3月份寻因生物进入商业化阶段,4个月的时间里,团队从20人发展至130人规模,营收也超过了千万元。为科研机构提供解决方案是营收的主要来源,此外还与医院医生合作,推动临床转化。
当前寻因生物的产品管线是围绕单细胞SeekOne为基础,未来公司将推出新的检测产品,并围绕临床业务进行技术开发。“由于目前单细胞测序的单价较高,覆盖群体并不广泛,因此寻因生物还将围绕一二线核心城市进行市场布局与拓展。”李宗文博士透露。
在融资方面,寻因生物已完成过亿元A轮融资,由博远资本领投,辰德资本跟投。据悉,寻因生物近期已启动新一轮融资。
本文文章头图来源于寻因生物,经授权使用。本文为创业邦原创,未经授权不得转载,否则创业邦将保留向其追究法律责任的权利。
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