多组学分析确定分子定义的阿尔茨海默病亚型
研究人员使用机器学习方法,整合了高通量的转录组学、蛋白质组学、代谢组学和脂质组学特征,为阿尔茨海默病(AD)提供了新的关键分子见解。
贝斯以色列女执事医疗中心
6月12日消息
组学分析是对大数据集进行分析,以提取生物分子(基因、DNA、RNA、蛋白质、代谢物等)的有意义信息的过程,其目标是阐明典型的分子通路,并破译疾病中出错的地方。
在一项由人类遗传学家、贝斯以色列女执事医疗中心(Beth Israel Deaconess Medical Center, BIDMC)神经内科神经生物样本库主任、医学博士 Bruno A. Benitez 领导的研究中,研究人员使用机器学习方法,整合了高通量的转录组学、蛋白质组学、代谢组学和脂质组学特征,为阿尔茨海默病(AD)提供了新的关键分子见解,这是单一组学分析无法提供的。这篇论文发表在《公共科学图书馆:生物学》(PLOS Biology)杂志上。
研究于2024年4月30日发表在《PLOS Biology》(最新影响因子:9.8)杂志上
跨组学方法确定了四种不同的 AD 分子特征,其中一种与较差的认知功能和神经病理学特征相关,包括死亡时显著较高的临床失智症评分,症状发作后较短的寿命,较严重的神经变性和神经炎症,以及较低的代谢组学水平。
这一分子特征存在于与更晚期疾病相关的多个受累皮质区域,即在 AD 中观察到更多的 tau 蛋白病理学,以及在 AD 早期和晚期改变的突触相关基因和信号通路的显著失调。
该团队的结果表明,跨组学分析可以捕获差异,并识别复杂和异质性疾病(如阿尔茨海默病)的分子变异,否则在单模态组学方法中会被遗漏。利用这种方法,科学家可以更好地了解这种疾病和其他疾病,并为新的突破和潜在的治疗铺平道路。
Benitez 说,跨组学方法可以作为研究人员努力了解阿尔茨海默病的有力工具。他补充说:“这些方法不仅优于单一组学分析,而且为这种疾病的发病机制提供了宝贵的分子见解。”
Benitez 说:“我们已经确定了反映突触功能障碍、认知和 AD 分期的疾病早期阶段的分子标志物,为精准医学铺平了道路。我们的研究作为 AD 患者的希望灯塔,激励我们继续不懈地追求知识和进步,我们希望在患阿尔茨海默病的 BIDMC 患者中重复这些发现。”
贝斯以色列女执事医疗中心是哈佛医学院主要的教学医院。它的前身是“贝斯以色列医院”(1916年成立)和“新英格兰女执事医院”(1896年成立),1996年2所医院合并
参考文献
Source:Beth Israel Deaconess Medical Center
In Brief: Multi-omics Analysis Identifies molecularly defined Alzheimer’s disease subtypes
Reference:
Abdallah M. Eteleeb et al, Brain high-throughput multi-omics data reveal molecular heterogeneity in Alzheimer's disease, PLOS Biology (2024). DOI: 10.1371/journal.pbio.3002607
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原文标题 : 多组学分析确定分子定义的阿尔茨海默病亚型
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