《Nature》:海洋微生物通过共生合作,合成维生素B12
01
文章背景简介
BACKGROUND INTRODUCTION
维生素B12(VitaminB12)是一种含钴的水溶性维生素,广泛应用于饲料和食品、保健和医疗行业。广义上,维生素B12是指一组含钴化合物(即钴胺素),包括氰钴胺、腺苷钴胺素、羟钴胺素和甲基钴胺素等,狭义上,通常说的的维生素B12是氰钴胺维生素B12的简称,维生素B12衍生物则包括:腺苷钴胺素、羟钴胺素和甲基钴胺素等。而维生素B12又分为医药级、食品级和饲料级。氰钴胺维生素B12一般是指医药级维生素B12,维生素B12衍生物都一般都是医药级,用于药品。维生素B12主要参与制造骨髓红细胞,具有防止恶性贫血、防止大脑神经受到破坏等作用,临床主要用于治疗巨幼红细胞性贫血等疾病,也有报道显示可用于治疗前列腺癌及多发性硬化症等。
我国最早于1966年,由华北制药开发成功维生素B12,产量一直较小,70年代仅有几十公斤,到九十年代后引进新的菌种后,采用新技术、新工艺,产量才大幅度上升。随后又有石药、宁夏金维、河北玉星等企业投产维生素B12。根据贝哲斯咨询统计的数据,全球与中国维生素B12市场规模在近年来持续增长。2023年,全球维生素B12市场规模达到了30.94亿元(人民币),而中国市场规模为13.21亿元。预计到2029年,全球维生素B12市场规模将以6.24%的增速达到44.24亿元(维生素B12的前沿研究,及市场规模)。
维生素B12是唯一含有金属元素的维生素,其分子的核心是一个与钴离子配位的咕啉环结构,结构极其复杂,咕啉环上总共有多达9个手性碳原子,化学合成难度很高。而在生物合成方面,天然的高等动植物不能制造维生素B12,自然界中的维生素B12都是微生物合成的,因此目前工业上维生素B12基本上只通过微生物发酵生产,根据资料显示,除了目前主流的生产菌费氏丙酸杆菌和脱氮假单胞菌外,还有巨大芽孢杆菌、乳杆菌、中华根瘤菌等能产生维生素B12。随着合成生物学的快速发展,通过代谢网络的基因编辑,是探索维生素B12高效生物合成的重要策略。
维生素B12分子结构
在海洋生态系统中,微生物扮演着至关重要的角色,它们不仅参与了生物地球化学循环,还影响着全球气候和生态平衡。维生素B12(钴胺素)作为大多数海洋原核生物和真核生物必需的辅酶,其合成和循环机制一直是微生物学研究的热点。然而,维生素B12在自然界中的分布极为有限,特别是在海洋环境中,其稀缺性对微生物相互作用和群落动态产生了显著影响。为了深入探索这一复杂的生态现象,德国Oldenburg大学的Gerrit Wienhausen等人在《Nature》(IF50.5,综合类一区)杂志上发表了题为“Ligand cross-feeding resolves bacterial vitamin B12 auxotrophies”的研究文章,为我们理解海洋微生物如何通过共生合作来合成和共享维生素B12提供了新的视角。
02
所用到的主要方法
METHODS
(1)基因组分析:通过测序和生物信息学工具分析微生物的基因组数据,揭示其生物学特性和代谢途径,如维生素B12的合成路径。
(2)共培养实验:在实验室条件下同时培养两种或多种微生物,研究它们之间的相互作用和共生关系,揭示微生物如何在自然环境中合作合成维生素B12。
(3)荧光原位杂交(FISH):利用荧光标记的特异性探针检测和定位特定的微生物,分析微生物群落结构和动态。
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文章主要内容摘要
ABSTRACT
维生素B12(钴胺素)是大多数海洋原核生物和真核生物的重要辅因子,由数量有限的原核生物合成,其稀缺性影响了微生物相互作用和群落动态变化。在这项研究中,作者发现两种维生素B12营养缺陷型细菌可以弥补不同的维生素B12构建模块并合作合成维生素B12。一种科尔韦尔氏菌(Colwelliasp.)可以合成并释放活化的下游配体α-核唑(α-ribazole),该配体被另一种维生素B12营养缺陷型玫瑰变色菌(Roseovariussp.)用来产生咕啉(corrin)环并合成维生素B12。Roseovariussp.仅在与Colwelliasp.共培养时才能释放维生素B12,并且仅在与Roseovariumsp.编码的原噬菌体的诱导时同步发生。在这些条件下,Colwelliasp的后续生长可能是由于Roseovariusp.裂解细胞提供了维生素B12。不过,原噬菌体诱导是否是维生素B12释放的起因,目前还需要进一步的证据来证。在海洋远洋生态系统中,这种配体交叉摄食以及联合合成维生素B12的复杂性微生物相互作用似乎很普遍。在热带大西洋西部和北部,预计能够回收钴啉醇酰胺(cobinamide)并仅合成活化的下游配体的细菌数量可能超过了维生素B12的生产菌。这些发现为我们理解海洋和其他生态系统中营养缺陷型微生物的B12供应增加了新的参考。
简而言之,本研究的主要内容有:
1.细菌间的配体交叉“饲喂”:Colwelliasp.如何合成并释放α-核唑(α-ribazole),以及Roseovariussp.如何利用这些配体来合成维生素B12。
2.噬菌体诱导与维生素B12释放的关联性:Roseovariussp.的噬菌体如何在Colwelliasp.存在时被诱导,以及这如何与维生素B12的释放相关联。
3.海洋微生物中维生素B12合成潜力的广泛性:通过分析海洋细菌基因组,揭示了维生素B12合成潜力在海洋微生物中的分布情况。
原文标题 : 《Nature》:海洋微生物通过共生合作,合成维生素B12
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